Sono 14 gli incontri che si sono svolti a Napoli tra i nerazzurri e i partenopei, ma nel corso degli anni la partita si è giocata in ben tre stadi diversi. In totale i nerazzurri hanno vinto una volta sola, ci sono stati tre pareggi e le rimanenti 10 gare sono state vinte dal Napoli.
Le prime gare infatti tra le due formazioni risalgono agli anni '40, quando entrambe giocavano in Serie B. All'epoca della prima sfida, terminata 1-1, il 21 marzo del 1943, si giocò al vecchio Stadio Partenopeo, anche noto come stadio Ascarelli. Successivamente, nel 1948-49 e nel 1949-50, sempre in Serie B, le due squadre si affrontarono all'impianto sportivo polivalente situato nel Vomero, lo stadio Arturo Collana. In entrambe le occasioni vinse il Napoli, rispettivamente 3-0 e 1-0.
Solo dopo venne costruito un nuovo impianto, il San Paolo, oggi noto come Diego Armando Maradona. La prima partita in Serie A risale al 1968-69, erano gli anni della dirigenza Donati che, con un exploit, riuscì a portare i nerazzurri per la prima volta nel massimo campionato italiano a girone unico. In quella occasione, di fronte a 60mila spettatori, furono ancora una volta i partenopei a vincere 2-1. Era l'ultima giornata di campionato a campionato ormai terminato, col Pisa che retrocesse col penultimo posto in classifica. A Sala replicò su rigore il pisano Mascalaito, poi il risultato fu fissato sul 2-1 grazie a un altro calcio di rigore, calciato da José Altafini.
Le sfide più importanti di disputarono negli anni successivi. Nel 1980-81 la prima di Coppa Italia con i nerazzurri battuti ancora una volta 1-0. L'esordio in Serie A nell'epoca Romeo Anconetani avvenne nel 1982-83. I padroni di casa passarono in vantaggio su rigore con Ferrario, poi fu Pellegrini ad andare al raddoppio in apertura di secondo tempo. Accorciò le distanze un rigore di Ugolotti a metà ripresa. Nel 1983-84 invece la sfida terminò in parità per 0-0.
Il primo e unico successo nerazzurro al San Paolo invece è datato 12 gennaio 1986. La partita fu risolta per 0-1 dall'uomo simbolo dei nerazzurri, Klaus Berggreen. L'azione fu un capolavoro, con Baldieri a pescare il numero 7 con un preciso pallone nel corridoio, quindi l'inserimento del danese per la rete che decise la partita, con un gran tiro di sinistro.
Il Napoli vinse ancora nel 1987-88 per 2-1 grazie alle reti di Renica e Maradona, mentre i nerazzurri accorciarono le distanze su autorete. Nel 1988-89 invece le due squadre si affrontarono sia in Coppa Italia che in campionato. Fu 0-0 in massima serie, mentre quella fu la stagione nella quale i nerazzurri acquisirono il miglior risultato di sempre in coppa, raggiungendo le semifinali e venendo battuti proprio dal Napoli. Al San Paolo, in quella occasione, si imposero i partenopei 1-0 con una rete di Romano, mentre all'andata a Pisa era stato Maradona, con Carnevale, già parzialmente a infrangere i sogni di gloria (0-2).
L'ultimo confronto in Serie A è del 1990-91. Ancora una volta a segno Maradona, quindi Careca al 90', ma il Pisa aveva segnato con Padovano la rete del momentaneo pareggio per il 2-1 finale.
Vi sono, nella storia recente, anche altre due gare. La prima risale all'epoca della ripartenza dei napoletani dalla Serie C, nel 2005/2006. Il Napoli dominò in lungo e in largo quella stagione in terza serie e ancora si ricorda la doppietta di Calaiò all'Arena Garibaldi. A Napoli replicò ancora lo stesso Calaiò per il 2-0 finale. I nerazzurri si salvarono per il rotto della cuffia contro la Massese ai playout con un gol di Eddy Baggio al 98'.
L'ultimo confronto assoluto invece è nel 2007 in Coppa Italia. Era l'anno di Kutuzov, Cerci e Castillo sotto la guida di Gianpiero Ventura. La sfida terminò 3-1 per il Napoli. Per i nerazzurri segnò lo zar bielorusso, mentre per il Napoli vi fu un'impressionante tripletta di Lavezzi, per una gara decisa solo ai supplementari.
Tutti i confronti:
1942-43 Serie B - Napoli - Pisa 1-1 (stadio Ascarelli)
1948-49 Serie B - Napoli - Pisa 3-0 (Stadio Arturo Collana)
1949-50 Serie B - Napoli - Pisa 1-0 (Stadio Arturo Collana)
1968-69 Serie A - Napoli - Pisa 2-1 (da questo momento in poi tutte le gare si sono giocate al San Paolo, oggi Stadio Diego Armando Maradona)
1980-81 Coppa Italia - Napoli - Pisa 1-0
1982-83 Serie A - Napoli - Pisa 2-1
1983-84 Serie A - Napoli - Pisa 0-0
1985-86 Serie A - Napoli - Pisa 0-1
1987-88 Serie A - Napoli - Pisa 2-1
1988-89 Serie A - Napoli - Pisa 0-0
1988-89 Coppa Italia - Napoli - Pisa 1-0
1990-91 Serie A - Napoli - Pisa 2-1
2005-06 Serie C1 - Napoli - Pisa 2-0
2007-08 Coppa Italia - Napoli - Pisa 3-1 dts