L'uomo è un senza fissa dimora che gravitava in zona stazione. Secondo quanto ricostruito dalla Polfer il treno merci proveniente da nord, in transito dalla stazione pisana, lo ha urtato mentre il giovane, ubriaco, si era seduto sulla banchina del binario 1 con le gambe penzoloni sulla linea ferroviaria e non si è accorto del convoglio, perché probabilmente era stordito dall'alcol.
Il treno, dopo l'investimento, ha proseguito la sua corsa mentre il giovane è stato trovato agonizzante, alcuni minuti dopo, da un addetto delle pulizie che ha avvisato 118 e polizia.
Il marocchino nell'urto col treno ha subito gravissime lesioni agli arti inferiori e in ospedale i medici sono stati costretti ad amputargli la gamba sinistra. Gravi le lesioni anche alla destra, con un piede amputato dal treno.